コイルドコイル

古典的なコイルドコイルの例の1つ、GCN4ロイシンジッパー。平行、左巻きの一量体である。

コイルドコイルはタンパク質の構造モチーフの1つで、2つから7つのαヘリックスがロープのように巻いた形をしている^[1]。コイルドコイル構造を持つタンパク質には、遺伝子発現を制御するものや転写因子など、重要な生物学的機能を持つものが多い。代表的なものにがん遺伝子由来のc-fos、junや筋肉中のトロポミオシンがある。

目次

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  1 コイルドコイルの分子構造
  


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  2 コイルドコイルの生物学的役割
  
  
  
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    2.1 HIVウイルスの侵入への役割
    
  
  
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    2.2 微生物細胞接着の役割
    
  
  
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    2.3 二量化タグとしてのコイルドコイル
    
  
  
  
  


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  3 研究の歴史
  


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  4 出典
  


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  5 参考文献
  

コイルドコイルの分子構造

コイルドコイルは H P P H P P Pという7残基の繰り返しを必ず含んでいる。ここでHは親水性アミノ酸、Pは疎水性アミノ酸である。ヘリックスと相互作用する領域にはロイシンジッパーなどの疎水性残基が多い。原形質のような水溶液中で2つのヘリックスを結合させる簡単な方法は、疎水性残基同士を内側に向けて貼り合わせることである。これで疎水性の面がなくなることが、二量化への熱力学的な原動力になっている。

αヘリックスは平行、または逆平行に配置し、左巻きのスーパーコイルを形成している。また数は少ないが右巻きのコイルドコイルも天然に存在する^[2]。

コイルドコイルの生物学的役割

HIVウイルスの侵入への役割

Gp41六量体の側面図

HIVウイルスはヒトの細胞に侵入する際に、3つの平行ヘリックスからなるコイルドコイル構造を持つ糖タンパク質 gp41を生産する。gp41の表面は普段はgp120という別のタンパク質に覆われ、抗体から守られている。HIVが標的の細胞に付着するとgp120が構造変化を起こしてgp41が露出し、gp41のN末端にある疎水性領域が細胞膜を貫通する。gp41の他の3つのヘリックスがコイルドコイルと合わさって6量体になり、ウイルスの膜と細胞膜を融合できるくらいに引き付ける。ウイルスはそうして細胞中に侵入し、複製を開始する。近年、gp41に結合するFuzeonの様な阻害剤も発見されている。

微生物細胞接着の役割

グラム陰性菌は三量体型オートトランスポーターアドヘシン (trimeric autotransporter adhesin, TAA) を細胞表層に発現することで，それぞれに特異的な表面に付着する。このTAAは主に七回周期のヘリックスからなるコイルドコイルからなる。

二量化タグとしてのコイルドコイル

その特異的な相互作用のために、コイルドコイルは二量化の「タグ」としても利用されている。また，これを改変し，三量体化，もしくは四量体化のタグとしても利用されている。

研究の歴史

αケラチン構造中のコイルドコイル構造の存在の可能性は1952年にフランシス・クリックによって初めて指摘された^[3]。驚くべきことに、これは、ライナス・ポーリングらによって1951年にαヘリックスの構造が提唱された直後のことだった^[4]。

出典

1. 
   ^ Liu, J; Zheng Q, Deng Y, Cheng CS, Kallenbach NR, and Lu M. (2006). “A seven-helix coiled coil”. P.N.A:S 103: 15457-62-15462. 
   


2. 
   ^ Harbury, PB; Plecs JJ, Tidor B, Alber T and Kim PS. (1998). “High-Resolution Protein Design with Backbone Freedom”. Science 282: 1462-1467. 
   


3. 
   ^ CRICK FH. Is alpha-keratin a coiled coil? Nature. 1952 Nov 22;170(4334):882-3. PMID 13013241
   


4. 
   ^ PAULING L, COREY RB, BRANSON HR. Proc Natl Acad Sci U S A. 1951 Apr;37(4):205-11. The structure of proteins; two hydrogen-bonded helical configurations of the polypeptide chain. PMID 14816373
   

参考文献

• Crick FHC. (1953) "The Packing of α-Helices: Simple Coiled-Coils", Acta Cryst., 6, 689-697.


• Nishikawa K. and Scheraga HA. (1976) "Geometrical Criteria for Formation of Coiled-Coil Structures of Polypeptide Chains", Macromolecules, 9, 395-407.


• Harbury PB, Zhang T, Kim PS and Alber T. (1993) "A Switch Between Two-, Three-, and Four-Stranded Coiled Coils in GCN4 Leucine Zipper Mutants", Science, 262, 1401-1407.


• Gonzalez L, Plecs JJ and Alber T. (1996) "An engineered allosteric switch in leucine-zipper oligomerization", Nature Structural Biology, 3, 510-515.


• Harbury PB, Plecs JJ, Tidor B, Alber T and Kim PS. (1998) "High-Resolution Protein Design with Backbone Freedom", Science, 282, 1462-1467.


• Yu YB. (2002) "Coiled-coils: stability, specificity, and drug delivery potential", Adv. Drug Deliv. Rev., 54, 1113-1129.


• Burkhard P, Ivaninskii S and Lustig A. (2002) "Improving Coiled-coil Stability by Optimizing Ionic Interactions", Journal of Molecular Biology, 318, 901-910.


• Gillingham AK and Munro S. (2003) "Long coiled-coil proteins and membrane traffic.", Biochim. Biophys. Acta, 1641, 71-85.


• Mason JM and Arndt KM, (2004) "Coiled coil domains: stability, specificity, and biological implications", Chembiochem, 5, 170-6.

表 話 編 歴 タンパク質の二次構造 ヘリックス 310ヘリックス αヘリックス ωヘリックス πヘリックス βヘリックス ポリプロリンヘリックス コラーゲンヘリックス 平面構造 βシート ターン βヘアピン βバルジ αシート 超二次構造 コイルドコイル ヘリックスターンヘリックス EFハンド ←一次構造 三次構造→

表 話 編 歴 タンパク質の四次構造 全般 球状タンパク質 線維状タンパク質 膜タンパク質 コイルドコイル 二量体 ロイシンジッパー 三量体 コラーゲン ヘマグルチニン オルニチントランスカルバミラーゼ 四量体 ヘモグロビン 免疫グロブリンG アビジン スペクトリン 六量体 dnaBヘリカーゼ ヘモシアニン グルタミンデヒドロゲナーゼ1 八量体 ヌクレオソーム ヘムエリスリン 微小繊維 アクチン チューブリン 鞭毛 性繊毛 線毛 複合体 転写開始前複合体 免疫グロブリンM カルボキシソーム 機械 プロテアソーム リボソーム ATP合成酵素 RNAポリメラーゼ スプライソソーム ウイルス カプシド 沈殿 塩析 ホフマイスターシリーズ 分類方法 超遠心分離 分子排斥クロマトグラフィー ←三次構造

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